新疆自然博物館，即中國科學院新疆生態與地理研究所新疆自然博物館，是關于新疆生態與地理的博物館、地理學、生物等自然科學是最大最豐富的博物館，也是國內為數不多的講內陸沙漠和干旱地區的科普場館。

新疆自然博物館位于新疆維吾爾自治區烏魯木齊市北京南路中華人民共和國中國2020年12月開館，前身是中國科學院新疆生態與地理研究所植物標本館。該博物館有80，000種植物標本、10000個脊椎動物標本和近1000個土壤、沙樣和礦物標本。新疆自然博物館是國家科普教育基地、國家環保科普基地等15個科普基地。

新疆自然歷史博物館由中國科學院新疆生態與地理研究所植物標本室升級而成。從上世紀50年代開始，中國科學院新疆綜合科學考察隊就開始考察新疆各地、采集標本。1956年，中國科學院新疆分院成立，新疆生物土壤沙漠研究所新疆地理研究所相繼成立。兩所合并前，僅中科院新疆生物土壤荒漠研究所就采集了8萬多份植物標本、8000多個動物標本、3000個土壤剖面圖和近1000個沙子樣本和微生物樣本。新疆生物土壤荒漠研究所標本室在參與編寫《中國植物志》時被列為全國十大標本室之一。同樣，中科院新疆地理研究所也保存了大量的巖石、礦物標本地層剖面數據和地球化學樣品。但在標本館建立之前，新疆生物土壤與沙漠研究所和新疆地理研究所都面臨著保存條件差的問題，導致部分標本無法上架，保存下來的標本也因蟲咬或污染而受損。

新疆自然博物館

為了解決標本陳列問題，方便今后的科學研究，中科院新疆分院從1984年開始向中科院申請建立標本館。1987年獲得批準，中科院同意投資420萬元建設總面積5000平方米的標本樓。然而，植物標本館遲遲沒有開始建設。1992年，中科院調整了新疆分院植物標本館的建設規劃，最終投資430萬元建成了4300平方米的植物標本館。植物標本館于1993年開始建設，并于1995年完工。建成后的植物標本館占地3439平方米。

1998年，中國科學院新疆生物土壤沙漠研究所和中國科學院新疆地理研究所合并為中國科學院新疆生態與地理研究所。該標本館也被命名為中國科學院新疆生態與地理研究所標本館。2006年，中國虛擬植物標本館開放到2017年，中國科學院新疆生態與地理研究所植物標本館已經上傳了超過10萬份標本數據。2019年底，中科院新疆生態與地理研究所植物標本館升級改造方案獲批。2020年12月28日，中國科學院新疆生態與地理研究所新疆自然博物館正式命名并開館。

新疆自然博物館分上下兩層，展廳面積2600平方米。新疆自然博物館有十個主題展廳，都是獨具特色的氣候展廳、巍峨山地展廳、瀲滟水系展廳、浩瀚荒漠展廳、多彩土壤展廳、繽紛綠洲展廳、數字空間展廳、殷阜礦產展廳、綠色生活展廳和自然精靈展廳。展出有例如梭梭、雪豹等植物、哺乳動物、爬行動物、兩棲類動物、鳥類、昆蟲、微生物、土壤、3500多個礦物標本等。此外，講述彭故事的《彭加木烈士事跡展》也在新疆自然博物館展出。除了舉辦展覽，新疆植物學會、新疆土壤學會、新疆地理學會、新疆自然資源學會新疆科學探索協會的學術交流和科普活動由新疆自然博物館安排策劃。

新疆自然博物館收藏的8萬號植物標本、10000個脊椎動物標本和近1000個土壤、沙樣和礦物標本。其中，國家二級保護植物鹽樺的兩個標本是我國僅有的兩個該種標本。新疆自然博物館最早的標本是1931年7月30日在新疆迪化的劉神娥（今烏魯木齊市）白楊溝百里香標本偽2956。